В комплекс инновационной инфраструктуры региона входят Научно-технологический парк Новосибирского Академгородка (Академпарк); Научно-технологический парк в сфере биотехнологий в наукограде Кольцово (Биотехнопарк), Инновационный Медико-Технологический Центр (ИМТЦ) (Медтехнопарк) и Медицинский промышленный парк (Медпромпарк).
В число объектов инновационной инфраструктуры Академпарка входит инжиниринговый центр комплексного мультиплатформенного тестирования программных продуктов и аппаратно-программных комплексов; региональный центр инжиниринга «IVD-инжиниринг»; Центр наноструктурированных материалов; Центр промышленных биотехнологий «ПромБиоТех». В систему технологических сервисов Академпарка входит Центр технологического обеспечения (Центр прототипирования и четыре инжиниринговых центра); Центр обработки данных; аналитическая лаборатория. Академпарк располагает самым большим в России бизнес-инкубатором.
В Центре коллективного пользования Биотехнопарка расположены: Сибирский окружной центр сертификации и декларирования лекарственных средств; испытательно-лабораторный центр с химико-аналитической и микробиологической лабораториями; магистратура биотехнологического профиля Новосибирского государственного университета; образовательный центр, организующий курсы повышения квалификации для фармкомпаний; детский технопарк.
Медицинский технопарк — первый в РФ действующий на основе механизмов государственно-частного партнерства. Сегодня у Медтехнопарка 239 резидентов. В июне 2016 года состоялось открытие первой очереди Медицинского промышленного парка.
В образовательных организациях высшего образования региона действуют 9 бизнес-инкубаторов, 2 студенческих технопарка. Созданы 45 малых инновационных предприятий.
На базе Инновационного кластера информационных и биофармацевтических технологий Новосибирской области создан научно-производственный кластер «Сибирский Наукополис». Среди основных достижений — более 100 образцов новой продукции, три новых объекта инновационной инфраструктуры и один — производственной.